Infección por SARS-CoV-2, endotelitis y ácidos biliares: una visión integradora / SARS-CoV-2 infection, endotheliitis and bile acids: an integrative view

Introducción: La endotelitis es causada por mecanismos complejos asociados a comorbilidades inmunitario-metabólicas como expresión del daño producido por diversos agentes, como el caso de las acciones proinflamatorias debidas a la interacción del virus SARS-CoV-2 con los ácidos biliares, que pueden estar implicadas en la mortalidad por la COVID-19. Objetivo: Describir las evidencias biomoleculares de la citotoxicidad de los ácidos biliares sobre el endotelio y la posible relación con la endotelitis de los cortes histológicos de tejidos de fallecidos por la COVID-19, asociada o no a las comorbilidades conocidas. Métodos: Se realizó una revisión sistemática y crítica de los artículos reportados sobre ácidos biliares y endotelitis desde 1963 hasta 2021 en los sitios web (PubMed, SciELO, Lilacs y Elservier). Se citó la histología del tejido pulmonar con daño endotelial en 34 fallecidos por COVID-19 en el Hospital Militar Central "Luis Díaz Soto", cuyos cortes histológicos fueron examinados en el Hospital Clínico Quirúrgico "Hermanos Ameijeiras". Asimismo, se describieron las acciones y las propiedades físico-químicas de los ácidos biliares que pudieran relacionarse con la endotelitis observada en dichos cortes histológicos. Conclusiones: Los ácidos biliares hidrofóbicos conjugados con glicinas, por sus propiedades e incrementos séricos hallados en las comorbilidades inmunitario-metabólicas y en las enfermedades hepato-intestinales, pudieran tener un papel en la endotelitis presente en pacientes de la COVID-19, con estadíos graves y críticos(AU)

Introduction: Endotheliitis is caused by complex mechanisms associated with immune-metabolic comorbidities as an expression of the damage produced by various agents, such as the case of proinflammatory actions due to the interaction of the SARS-CoV-2 virus with bile acids, which may be involved in mortality from COVID-19. Objective: To describe the biomolecular evidence of bile acid cytotoxicity on the endothelium and the possible relationship with endothelitis of histological sections of tissues from COVID-19 deaths, associated or not with known comorbidities. Methods: A systematic and critical review of the articles reported on bile acids and endothelitis from 1963 to 2021 was conducted on the websites (PubMed, SciELO, Lilacs and Elservier). It was cited the histology of lung tissue with endothelial damage in 34 deceased by COVID-19 at "Luis Díaz Soto" Central Military Hospital, whose histological sections were examined at "Hermanos Ameijeiras" Clinical Surgical Hospital. Likewise, the actions and physicochemical properties of bile acids that could be related to observed endothelitis in these histological sections were described. Conclusions: Hydrophobic bile acids conjugated with glycine, due to their properties and serum increases found in immune-metabolic comorbidities and hepato-intestinal diseases, could have a role in endothelitis present in COVID-19 patients, with severe and critical stages(AU)

High Levels of Serum Bile Acids in COVID-19 Patients on Hospital Admission.

INTRODUCTION: Bile acids are signaling molecules with immune, metabolic and intestinal microbiota control actions. In high serum concentrations they increase inflammatory response from the liver-gut axis, until causing multiorgan failure and death; therefore, they may be associated with COVID-19's clinical progression, as a consequence of tissue and metabolic damage caused by SARS-CoV-2. While this topic is of considerable clinical interest, to our knowledge, it has not been studied in Cuba. OBJECTIVE: Study and preliminarily characterize patients admitted with a diagnosis of COVID-19 and high levels of serum bile acids. METHODS: A preliminary exploratory study was carried out with descriptive statistical techniques in 28 COVID-19 patients (17 women, 11 men; aged 19-92 years) who exhibited high levels of serum bile acids (≥10.1 µmol/L) on admission to the Dr. Luis Díaz Soto Central Military Hospital in Havana, Cuba, from September through November 2021. RESULTS: On admission patients presented hypocholesterolemia (13/28; 46.4%), hyperglycemia (12/28; 43.0%) and hyper gamma-glutamyl transpeptidase (23/28; 84.2%). Median blood glucose (5.8 mmol/L) and cholesterol (4.1 mmol/L) were within normal ranges (3.2‒6.2 mmol/L and 3.9‒5.2 mmol/L, respectively). Severe or critical stage was the most frequent (13/28) and median serum bile acids (31.6 µmol/L) and gamma-glutamyl transferase (108.6 U/L) averaged well above their respective normal ranges (serum bile acids: 0‒10 µmol/L; GGT: 9‒36 U/L). Arterial hypertension was the most frequent comorbidity (19/28; 67.9%). CONCLUSIONS: Severe or critical stage predominated, with serum bile acids and gamma-glutamyl transferase blood levels above normal ranges. The study suggests that serum bile acid is toxic at levels ≥10.1 µmol/L, and at such levels is involved in the inflammatory process and in progression to severe and critical clinical stages of the disease. In turn, this indicates the importance of monitoring bile acid homeostasis in hospitalized COVID-19 patients and including control of its toxicity in treatment protocols.

Experiencias de autopsias a fallecidos por la COVID-19 / Autopsy experiences of deceased by COVID-19

RESUMEN Introducción: Se presenta un caso de paciente fallecido por la COVID-19, que los autores consideran prototipo de la mayor parte de los fallecidos por esta afección, que se le realizó a autopsia. Objetivo: Divulgar las experiencias en el estudio de la autopsia de este tipo de pacientes y contribuir a su aplicación en la práctica asistencial y científica. Caso clínico: Se presenta un paciente masculino de 78 años, con hipertensión arterial, diabetes mellitus y obesidad, que comenzó con tos, fiebre, secreción nasal, que ingresa con diagnóstico de la COVID-19, evoluciona hacia la gravedad y fallece 10 días después de su ingreso. Se presentan los elementos fundamentales de la historia clínica, los diagnósticos de causas de muerte pre mortem y post mortem. Se precisan los diagnósticos en la autopsia y los resultados de la evaluación de la calidad de los diagnósticos de causas de muerte clínicos. Conclusiones: Las experiencias del estudio de esta autopsia como prototipo, reafirman los daños ocasionados por el SARS-CoV-2 y aporta a los conocimientos de este campo.

ABSTRACT Introduction: A case of a patient who died from COVID-19 is presented, which the authors consider to be the prototype of most of those who died from this condition, which was performed at autopsy. Objective: Disseminate the experiences in the study of the autopsy of this type of patients and contribute to its application in clinical and scientific practice. Clinical case: A 78-year-old male patient is presented, with arterial hypertension, diabetes mellitus and obesity, who began with cough, fever, runny nose, who was admitted with a diagnosis of COVID-19, progressed to severity and died 10 days later. of his admittance. The fundamental elements of the clinical history, the diagnoses of causes of death pre-mortem and post-mortem are presented. Autopsy diagnoses and quality assessment results of clinical cause of death diagnoses are specified. Conclusions: The experiences of the study of this autopsy as a prototype, reaffirm the damage caused by SARS-CoV-2 and contribute to the knowledge of this field.

Visión de las causas de muerte por la COVID-19 con las experiencias de las autopsias / Vision of the causes of death by COVID-19 with the experiences of autopsies

RESUMEN El 30 de enero de 2020, la Organización Mundial de la Salud declaró a la infección por SARS-CoV-2 una emergencia internacional de salud pública. La autopsia, considerada el mejor método de estudio del enfermo y la enfermedad, corrobora que los pacientes pueden morir por la acción directa del virus (fallecidos por la COVID-19), mientras que otros positivos al SARS-CoV-2, no mostraron cambios morfológicos pulmonares atribuidos a la acción del virus. Se propone establecer los criterios diagnósticos morfológicos en el contexto de la epidemia por el SARS-CoV-2 y la COVID-19 en los fallecidos en Cuba, a partir del estudio sistemático de las autopsias. Se han identificado los patrones morfológicos que se establecen en los pulmones de los pacientes fallecidos bajo el efecto de la COVID-19. El edema pulmonar de permeabilidad con el ensanchamiento de tabique pulmonar, el depósito de la membrana hialina desorganizada en el interior de los alveolos, el desprendimiento de células epiteliales (neumocitos y células bronquiales y bronquiolares), seguida de la hiperplasia epitelial con presencia en ocasiones de cambios metaplásicos y atipias, y finalmente, la fibrosis. Cuando se realizan autopsias, es posible ubicar cada enfermedad en su lugar, en el cronopatograma, lo que permite realizar el reparo de los certificados de defunción, para evaluar el lugar que la COVID-19 ha ocupado como causa de muerte en la población estudiada. En criterio del colectivo, identificar en las alteraciones morfológicas, es imprescindible para elaborar el cronopatograma del fallecido y la adecuada evaluación clínico patológica del paciente.

ABSTRACT On January 30, 2020, the World Health Organization (WHO) declared SARS-CoV-2 infection an international public health emergency. The autopsy, considered the best method of studying the patient and the disease, corroborates that patients can die from the direct action of the virus (who died from COVID-19), while others positive for SARS-CoV-2 did not show morphological lung changes attributed to the action of the virus. It is proposed to establish the morphological diagnostic criteria in the context of the SARS-CoV-2 and COVID-19 epidemic in the deceased in Cuba based on the systematic study of autopsies. The morphological patterns that are established in the lungs of patients who died under the effect of COVID-19 have been identified. The pulmonary edema of permeability with the widening of the pulmonary septum, the deposit of the disorganized hyaline membrane inside the alveoli, the detachment of epithelial cells (pneumocytes and bronchial and bronchiolar cells), followed by epithelial hyperplasia with sometimes the presence of metaplastic changes and atypia, and finally, fibrosis. When autopsies are performed, it is possible to locate each disease in its place, in chronopathogram, which allows death certificates repair to be carried out to assess the place that COVID-19 has occupied as a cause of death in the population studied. In the opinion of the group, identifying morphological alterations is essential to prepare the chronopathogram of the deceased and the adequate clinical-pathological evaluation of the patient.

Autopsia y certificados médicos de defunción en fallecidos relacionados con la COVID-19

RESUMEN Introducción: La pandemia de la COVID-19 ha sido la mayor del siglo actual y motivo de numerosos trabajos científicos. En Cuba se ha constituido el Grupo Temporal de Anatomía Patológica para estudiar las autopsias de los fallecidos por la COVID-19 (más de 400). Los certificados médicos de defunción, documentos de inestimable valor, en Cuba se reparan de acuerdo a los resultados de las autopsias, para elevar su calidad. Objetivos: Evaluar los resultados de las autopsias con diagnósticos de COVID-19, comparadas con los certificados médicos de defunción. Métodos: Se evaluaron los diagnósticos de causas de muerte de 65 autopsias del año 2020 con sus certificados médicos de defunción. Los diagnósticos fueron procesados en el Sistema Automatizado de Registro y Control de Anatomía Patológica. Se analizaron las causas directas de muerte, causas básicas de muerte, causas de muerte intermedias y causas de muerte contribuyentes. Se definió la coincidencia total de ambos diagnósticos, coincidencia parcial, no coincidencia o discrepancia diagnóstica y datos insuficientes. Resultados: Las discrepancias diagnósticas de causa básica y directa de muerte son 46,2 % y 60,0 % del total de casos y 19,4 % y 64,5 % cuando la COVID-19 fue causa básica de muerte. Las elevadas cifras de discrepancias diagnósticas, se corresponden con las reportadas en estudios previos, tanto en diagnósticos clínicos como en los certificados médicos de defunción. Conclusiones: Existe elevadas cifras de discrepancias diagnósticas en los resultados de las autopsias con diagnósticos de COVID-19, comparadas con los certificados médicos de defunción.

ABSTRACT Introduction: The COVID-19 pandemic has been the largest in the current century and the reason for numerous scientific works. In Cuba, the Temporary Group of Pathological Anatomy has been established to study the autopsies of those who died from COVID-19 (more than 400). The medical death certificates, documents of inestimable value, in Cuba are repaired according to the results of the autopsies, to raise their quality. Objectives: To evaluate the results of autopsies with COVID-19 diagnoses, compared to medical death certificates. Methods: The diagnoses of causes of death of 65 autopsies of the year 2020 were evaluated with their medical death certificates. The diagnoses were processed in the Automated System for the Registration and Control of Pathology. Direct causes of death, basic causes of death, intermediate causes of death, and contributing causes of death were analyzed. The total agreement of both diagnoses was defined, partial agreement, diagnostic mismatch or discrepancy, and insufficient data. Results: Diagnostic discrepancies of basic and direct cause of death are 46.2 % and 60.0 % of all cases and 19.4 % and 64.5 % when COVID-19 was basic cause of death. The high figures for diagnostic discrepancies correspond to those reported in previous studies, both in clinical diagnoses and in medical death certificates. Conclusions: There are high numbers of diagnostic discrepancies compared with the results of autopsies with COVID-19 diagnoses, compared to medical death certificates.

Utilidad de la prueba de la lactato deshidrogenasa en fallecidos cubanos con sida y neumonía por Pneumocystis jirovecii

RESUMEN Introducción: La neumonía por Pneumocystis jirovecii es una de las enfermedades de mayor impacto negativo en los pacientes con sida. La imposibilidad de cultivar el agente que la provoca, así como su cuadro clínico inespecífico y el alto costo de los métodos diagnósticos moleculares, señalan la necesidad de otras alternativas para su diagnóstico. La prueba de la lactato deshidrogenasa representa una opción a considerar. Objetivo: Demostrar la utilidad de la prueba de la lactato deshidrogenasa como diagnóstico de la Pneumocystis jirovecii en fallecidos cubanos por sida. Métodos: Se realizó un estudio de casos y controles (25 casos [Pneumocystis jirovecii] y 30 controles [compuestos por tres grupos: tuberculosis, linfoma y neumonía bacteriana, respectivamente]) en fallecidos cubanos a los que se realizó la autopsia desde enero de 1996 a diciembre de 2016. Se utilizaron cinco rangos de corte para buscar el valor óptimo de la prueba. Resultados: En el presente estudio existen diferencias altamente significativas entre los pacientes analizados (casos y controles) y entre los restantes individuos que componen los controles con respecto al del linfoma. El rango de corte óptimo para la prueba de la lactato deshidrogenasa fue (550-<800 U/I) con sensibilidad de 80 % y especificidad de 63 %. La razón de disparidad (OR) demostró que existe 6,91 veces más probabilidades que los pacientes por Pneumocystis jirovecii tengan las cifras de LDH mayor que los pacientes controles. Conclusiones: Este trabajo aporta evidencias científicas del rol de la prueba de la lactato deshidrogenasa como herramienta complementaria para el diagnóstico de la Pneumocystis jirovecii.

ABSTRACT Introduction: Pneumocystis jirovecii pneumonia is one of the diseases causing the greatest negative impact on AIDS patients. The impossibility of culturing its causative agent, its unspecific clinical presentation and the high cost of molecular diagnostic methods, make it necessary to find other diagnostic alternatives. The lactate dehydrogenase test is an option to be considered. Objective: Demonstrate the usefulness of the lactate dehydrogenase test to diagnose Pneumocystis jirovecii in Cuban patients deceased with AIDS. Methods: A case-control study was conducted (25 cases [Pneumocystis jirovecii] and 30 controls [distributed into three groups: tuberculosis, lymphoma and bacterial pneumonia, respectively]) of Cuban deceased patients undergoing post-mortem examination from January 1996 to December 2016. Five cutoff ranges were used to find the optimal value of the test. Results: Highly significant differences were found between the patients analyzed (cases and controls) and between the remaining individuals making up the controls with respect to the one with lymphoma. The optimal cutoff range for the lactate dehydrogenase test was 550-<800 U/I, with 80% sensitivity and 63% specificity. The odds ratio (OR) showed that probabilities are 6.91 times greater that Pneumocystis jirovecii pneumonia patients have higher LDH figures than control patients. Conclusions: Scientific evidence is contributed of the role of the lactate dehydrogenase test as a complementary tool in the diagnosis of Pneumocystis jirovecii.

Hallazgos radiológicos de la neumonía por Pneumocystis jirovecii en fallecidos cubanos con VIH/sida / Radiological findings of Pneumocystis jirovecii pneumonia in Cuban deceased HIV / AIDS patients

Introducción: La neumonía por Pneumocystis jirovecii (PcP) es una de las enfermedades más frecuentes en los pacientes con VIH/sida y provoca una alta morbilidad y mortalidad. La radiología juega un papel fundamental para su diagnóstico presuntivo. Objetivo: Describir los hallazgos radiológicos de neumonía por Pneumocystis jirovecii en una serie de casos de fallecidos cubanos por VIH/sida, y relacionarlos con el estado inmunológico de los pacientes. Métodos: Se realizó el estudio de una serie de 69 fallecidos por sida con PcP en el Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí desde enero de 1996 a enero de 2014. El diagnóstico de la PcP se confirmó por estudios anatomopatológicos mediante la observación de estructuras compatibles con el hongo. Resultados: De los 69 casos del estudio, 57 (82,6 por ciento) presentaron alteraciones en la radiografía de tórax. De ellos, 44 (77,2 por ciento) y 13 (22,8 por ciento) presentaron un patrón radiológico típico y atípico de la PcP, respectivamente. En 12 (17,4 por ciento) fallecidos la radiografía de tórax fue normal. En 76,8 por ciento de los casos se detectó niveles de linfocitos T CD4+ inferior a 200 cél/ 956;L. La relación entre el patrón radiológico y el estado inmunológico de los fallecidos analizados no fue significativa. Conclusiones: Los hallazgos radiológicos descritos en los fallecidos cubanos por sida con PcP son similares a los informados en la literatura internacional. Sin embargo, el diagnóstico de la PcP no debe excluirse en pacientes con radiografías de tórax normales o con patrones atípicos que presenten un cuadro clínico sugestivo de la enfermedad(AU)

Introduction: Pneumocystis jirovecii pneumonia (PcP) is one of the most common diseases among HIV / AIDS patients, causing great morbidity and mortality. Radiology plays a fundamental role in its presumptive diagnosis. Objective: Describe the radiological findings of Pneumocystis jirovecii pneumonia in a series of Cuban deceased HIV / AIDS patients and relate them to the patients' immune status. Methods: A study was conducted of a series of 69 deceased AIDS patients with PcP at Pedro Kourí Tropical Medicine Institute from January 1996 to January 2014. PcP diagnosis was confirmed through anatomopathological studies based on observation of structures compatible with the fungus. Results: Of the 69 study cases, 57 (82.6 percent) presented alterations in their chest radiographs. Of these, 44 (77.2 percent) and 13 (22.8 percent) followed a typical and atypical radiological pattern, respectively. In 12 deceased patients (17.4 percent) chest radiography was normal. In 76.8 percent of the cases, levels of T CD4+ lymphocytes were below 200 cell/ml. The relationship between the radiological pattern and the immune status of the deceased patients analyzed was not significant. Conclusions: The radiological findings described for Cuban deceased AIDS patients with PcP are similar to those reported in the international literature. However, PcP diagnosis should not be excluded in patients with normal chest radiographs or atypical patterns who present a clinical status suggestive of the disease(AU)

Molecular and histological tools to diagnose an imported case of American cutaneous leishmaniasis in Cuba.

BACKGROUND: Leishmaniasis represents a polymorphous group of diseases caused by around 20 different species of Leishmania parasite. Increases in the number of cases of leishmaniasis reported as a consequence of the growth in travel and migration are of concern to epidemiologists and are diagnostically challenging in non-endemic areas. METHODS: Molecular and histological analyses of a paraffin-embedded skin biopsy were used in parallel to detect Leishmania parasites in a Cuban woman with suspicious lesions arriving in Cuba from Venezuela. Primers based on the 18S fragment of ribosomal ribonucleic acid (rRNA) and heat shock protein 70 genes (hsp70) were used for molecular detection. RESULTS: Histological studies detected the presence of the parasite. A small fragment of Leishmania DNA was amplified by polymerase chain reaction (PCR) targeting the 18S fragment using, for the first time, nucleic acid obtained from paraffin-embedded tissue as a template. Amplification of a larger fragment from the hsp70 gene did not occur. CONCLUSIONS: The detection of Leishmania DNA from paraffin-embedded tissue by means of 18S-targeted PCR is a feasible approach to diagnosis. In combination with classical methods such as histology, the molecular detection of the parasite was demonstrated to be useful in confirming Leishmania infection in a traveler.

Normalización de un método inmunoquímico para detectar Papilomavirus humano tipo 16 en lesiones cérvico-uterinas / Standardization of immunochemical method for detection of type 16 human papilomavirus in cervix uterine lesions

Introducción: la infección por Papilomavirus Humano (PVH) es la condición necesaria para la aparición y desarrollo del cáncer cérvico-uterino. Los genotipos de alto riesgo oncogénico son los causantes de este tipo de neoplasia y dentro de ellos el más frecuente es el PVH 16, que se encuentra aproximadamente en el 60 por ciento de los casos. Los métodos de diagnóstico comerciales resultan costosos para países con escasos recursos económicos, lo que sugiere la búsqueda de alternativas empleando protocolos sencillos y baratos. Objetivos: normalizar un método inmunoquímico para la detección del antígeno L1 de PVH tipo 16 en muestras cérvico-uterinas de pacientes con lesiones intraepiteliales escamosas y determinar la coincidencia entre el método normalizado y la Reacción en Cadena de la Polimerasa en Tiempo Real (RCP-TR), como técnica de referencia, para estimar la utilidad de dicho método en el diagnóstico de la infección por este genotipo viral. Métodos: se compararon tres procedimientos de inmunotinción (Indirecto de inmunoperoxidasa en dos pasos, Estreptavidina-Biotina y Amplificación por polímero) respecto a sensibilidad analítica, tinción inespecífica de fondo y tiempo de terminación, para la detección de la proteína L1 de PVH 16 en líneas celulares derivadas de carcinomas cervicales humanos y en muestras cérvico-uterinas utilizadas como controles. El protocolo normalizado se aplicó a muestras cérvico-uterinas de mujeres entre 30 y 59 años, 82 con lesiones intraepiteliales cervicales y 10 sin antecedentes de alteraciones citológicas, a las que además se les determinó PVH 16 mediante RCP-TR. Resultados: el procedimiento de Estreptavidina-Biotina resultó el más sensible y específico...

Introduction: Human Papillomavirus (HPV) infection is the necessary condition for the occurernce and development of cervical cancer. The high oncogenic risk genotypes are the responsible for this type of neoplasia and the most frequent is HPV 16 that affects roughly 60 percent of cases. Commercial kits for HPV detection are expensive for resource-poor countries, which suggests the search for alternative throguh non-expensive simple protocoles. Objectives: to standardize an immunochemical method for the detection of HPV 16 L1 antigen in cervical samples of patients with squamous intraepithelial lesions and to determine the diagnostic coincidence between the immunochemical method and the real-time polymerase chain reaction to estimate the usefulness of this method for the detection of cervical infection with this viral genotype. Methods: three immunostaining methods (Two-Step Indirect Immunoperoxidase, Labelled Streptavidin-Biotin and Enhanced Polymer) were compared in terms of analytical sensitivity, nonspecific background staining and time of completion, for the detection of protein L1 of HPV-16 in a cell line derived from human cervical carcinoma and clinical samples from uterine cervix. The optimized protocol was applied to 82 cervical samples from women aged 30-59 years with squamous intraepithelial lesions and to 10 samples of sexually active women without previous signals of positive cytology. The presence of type 16 HPV was also detected with the aid of RT-PCR. Results: the Streptavidin-Biotin system was the most sensitive and specific...

Normalización de un método inmunoquímico para detectar Papilomavirus humano tipo 16 en lesiones cérvico-uterinas / Standardization of immunochemical method for detection of type 16 human papilomavirus in cervix uterine lesions

Introducción: la infección por Papilomavirus Humano (PVH) es la condición necesaria para la aparición y desarrollo del cáncer cérvico-uterino. Los genotipos de alto riesgo oncogénico son los causantes de este tipo de neoplasia y dentro de ellos el más frecuente es el PVH 16, que se encuentra aproximadamente en el 60 % de los casos. Los métodos de diagnóstico comerciales resultan costosos para países con escasos recursos económicos, lo que sugiere la búsqueda de alternativas empleando protocolos sencillos y baratos. Objetivos: normalizar un método inmunoquímico para la detección del antígeno L1 de PVH tipo 16 en muestras cérvico-uterinas de pacientes con lesiones intraepiteliales escamosas y determinar la coincidencia entre el método normalizado y la Reacción en Cadena de la Polimerasa en Tiempo Real (RCP-TR), como técnica de referencia, para estimar la utilidad de dicho método en el diagnóstico de la infección por este genotipo viral. Métodos: se compararon tres procedimientos de inmunotinción (Indirecto de inmunoperoxidasa en dos pasos, Estreptavidina-Biotina y Amplificación por polímero) respecto a sensibilidad analítica, tinción inespecífica de fondo y tiempo de terminación, para la detección de la proteína L1 de PVH 16 en líneas celulares derivadas de carcinomas cervicales humanos y en muestras cérvico-uterinas utilizadas como controles. El protocolo normalizado se aplicó a muestras cérvico-uterinas de mujeres entre 30 y 59 años, 82 con lesiones intraepiteliales cervicales y 10 sin antecedentes de alteraciones citológicas, a las que además se les determinó PVH 16 mediante RCP-TR. Resultados: el procedimiento de Estreptavidina-Biotina resultó el más sensible y específico. La coincidencia entre el método inmunoquímico y la RCP-TR fue de un 98,6 por ciento, la sensibilidad fue de un 98,57 por ciento y la especificidad de un 91,67 por ciento, con valores predictivos negativo y positivo por encima del 90 por ciento. Conclusiones: se demostró la validez del método inmunoquímico como prueba confirmatoria de la infección por PVH 16. Dicho método probó ser sensible, sencillo y no requiere de una compleja infraestructura para detectar PVH 16 en muestras cervicales. Además, esta técnica permite obtener información rápidamente y evita el uso de métodos invasivos(AU)

Introduction: Human Papillomavirus (HPV) infection is the necessary condition for the occurernce and development of cervical cancer. The high oncogenic risk genotypes are the responsible for this type of neoplasia and the most frequent is HPV 16 that affects roughly 60 percent of cases. Commercial kits for HPV detection are expensive for resource-poor countries, which suggests the search for alternative throguh non-expensive simple protocoles. Objectives: to standardize an immunochemical method for the detection of HPV 16 L1 antigen in cervical samples of patients with squamous intraepithelial lesions and to determine the diagnostic coincidence between the immunochemical method and the real-time polymerase chain reaction to estimate the usefulness of this method for the detection of cervical infection with this viral genotype. Methods: three immunostaining methods (Two-Step Indirect Immunoperoxidase, Labelled Streptavidin-Biotin and Enhanced Polymer) were compared in terms of analytical sensitivity, nonspecific background staining and time of completion, for the detection of protein L1 of HPV-16 in a cell line derived from human cervical carcinoma and clinical samples from uterine cervix. The optimized protocol was applied to 82 cervical samples from women aged 30-59 years with squamous intraepithelial lesions and to 10 samples of sexually active women without previous signals of positive cytology. The presence of type 16 HPV was also detected with the aid of RT-PCR. Results: the Streptavidin-Biotin system was the most sensitive and specific. The diagnostic agreement between the immunochemical method and the real-time polymerase chain reaction reached 98.6 percent, sensitivity was 98.57 percent and specificity was 91.67 %, with positive and negative predictive values above 90 percent. Conclusions: the validity of the immunochemical method as a confirmatory test for infection by HPV-16 has been demonstrated. The normalized immunochemical method proved to be a sensitive, simple, relatively fast method to detect HPV from clinical samples of cervical cells. Furthermore, this method provides information quickly, avoiding the use of invasive methods in patients(AU)

Pneumocystis jirovecii en Cuba: ¿Qué sabemos realmente? / Pneumocystis jirovecii in Cuba: What do we really know?

En la actualidad, el término Pneumocystis hace referencia a un género de hongos unicelulares que infecta a diferentes mamíferos, incluido el ser humano. Sin embargo, originalmente, se creó para describir a un único microorganismo denominado Pneumocystis carinii, que durante más de 80 años se consideró de manera errónea como un protozoo capaz de infectar una amplia variedad de especies de animales. Esta idea se mantuvo hasta finales de los años ochenta del siglo xx, cuando mediante técnicas de biología molecular se pudo caracterizar como un hongo atípico. Estudios posteriores permitieron demostrar que no se trataba de un patógeno único, sino de un grupo de microorganismos ubicuos con tropismo pulmonar y alta especificidad por sus hospedadores, que constituían especies diferentes dentro del género Pneumocystis. Hasta el momento actual, se han caracterizado 5 de estas especies, incluido Pneumocystis jirovecii que es la que infecta al ser humano.1La neumonía causada por P. jirovecii continua siendo una de las enfermedades oportunistas más frecuentes en los pacientes con infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH), a pesar del empleo de quimioprofilaxis y de la terapia antirretroviral de gran actividad. Por otra parte, su incidencia parece estar aumentando entre individuos con otras causas de inmunodepresión, donde la mortalidad puede alcanzar hasta 50 por ciento, como los pacientes con enfermedades autoinmunes, con cáncer o con trasplantes y, recientemente, en los tratados con los nuevos fármacos biológicos inmunomoduladores.2La carencia de un medio de cultivo para el crecimiento de este microorganismo es un obstáculo importante para su estudio, que ha dificultado el conocimiento de su epidemiología, así como de su biología y susceptibilidad a los fármacos. Por esa razón, muchos de los aspectos que se conocen del patógeno han sido gracias al empleo de técnicas moleculares. Estas técnicas, como la reacción en cadena de la polimerasa, han permitido...(AU)

Pneumocystis jirovecii en Cuba: ¿Qué sabemos realmente? / Pneumocystis jirovecii in Cuba: What do we really know?

En la actualidad, el término Pneumocystis hace referencia a un género de hongos unicelulares que infecta a diferentes mamíferos, incluido el ser humano. Sin embargo, originalmente, se creó para describir a un único microorganismo denominado Pneumocystis carinii, que durante más de 80 años se consideró de manera errónea como un protozoo capaz de infectar una amplia variedad de especies de animales. Esta idea se mantuvo hasta finales de los años ochenta del siglo xx, cuando mediante técnicas de biología molecular se pudo caracterizar como un hongo atípico. Estudios posteriores permitieron demostrar que no se trataba de un patógeno único, sino de un grupo de microorganismos ubicuos con tropismo pulmonar y alta especificidad por sus hospedadores, que constituían especies diferentes dentro del género Pneumocystis. Hasta el momento actual, se han caracterizado 5 de estas especies, incluido Pneumocystis jirovecii que es la que infecta al ser humano.1La neumonía causada por P. jirovecii continua siendo una de las enfermedades oportunistas más frecuentes en los pacientes con infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH), a pesar del empleo de quimioprofilaxis y de la terapia antirretroviral de gran actividad. Por otra parte, su incidencia parece estar aumentando entre individuos con otras causas de inmunodepresión, donde la mortalidad puede alcanzar hasta 50 por ciento, como los pacientes con enfermedades autoinmunes, con cáncer o con trasplantes y, recientemente, en los tratados con los nuevos fármacos biológicos inmunomoduladores.2La carencia de un medio de cultivo para el crecimiento de este microorganismo es un obstáculo importante para su estudio, que ha dificultado el conocimiento de su epidemiología, así como de su biología y susceptibilidad a los fármacos. Por esa razón, muchos de los aspectos que se conocen del patógeno han sido gracias al empleo de técnicas moleculares. Estas técnicas, como la reacción en cadena de la polimerasa, han permitido...

Identificación molecular de helicobacter pylori en tejidos gástricos con neoplasias malignas embebidos en parafina / Molecular identification of helicobacter pylori in paraffin embedded gastric tissues with malignant neoplasm

Introducción: Helicobacter pylori es considerado uno de los principales agentes causales de gastritis crónica, úlcera péptica y neoplasias gástricas malignas en humanos. Objetivo: evaluar el uso de la reacción en cadena de la polimerasa para la identificación de H. pylori y sus genotipos en tejidos gástricos con neoplasias malignas embebidos en parafina. Material y Métodos: se estudiaron secciones de 5 bloques de parafina procedentes de 5 pacientes mexicanos con neoplasias gástricas malignas. Se realizaron coloraciones de rutina y especiales de anatomía patológica, así como la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa para la detección del microorganismo y sus genotipos. Resultados: la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa identificó a este agente infeccioso en todos los bloques analizados en correspondencia con su detección a través de las técnicas histológicas. Esta metodología permitió demostrar una variabilidad genética del patógeno en las muestras analizadas según los genotipos vacA y cagA. Conclusiones: la reacción en cadena de la polimerasa podría ser un método eficaz en la identificación del H. pylori en tejidos gástricos con neoplasias malignas embebidos en parafina. Esta se perfila como una estrategia atractiva para realizar estudios de epidemiología molecular y permitirá establecer posibles asociaciones de genotipos/ subtipos del microorganismo con variables clínicas, epidemiológicas y de manejo del paciente(AU)

Introduction: Helicobacter pylori is considered one of the main causal agents of chronic gastritis, peptic ulcer and gastric malignant neoplasms in humans. Objective: to evaluate polymerase chain reaction for identification of Helicobacter pylori and its genotypes in paraffin embedded gastric tissues with malignant neoplasms. Material and Methods: sections of five paraffin blocks from five patients with gastric malignant neoplasms were studied. They were analyzed through routine and special stains of pathological anatomy, as well as the polymerase chain reaction technic for microorganism and genotypes detection. Results: the infectious agent was identified in all of the analyzed blocks through the polymerase chain reaction technic in correspondence with its detection through histologic techniques. This methodology showed a genetic variability of the pathogen in the analyzed samples in respect to vacA and cagA genotypes. Conclusions: the polymerase chain reaction could be an efficacious method for the identification of H. pylori in paraffin embedded gastric tissues with malignant neoplasms. It is projected as an attractive strategy for performing studies of molecular epidemiology and the establishment of possible associations between genotypes/subtypes of the microorganism and clinic or epidemiologic variables, and patient handling(AU)

Identificación molecular de helicobacter pylori en tejidos gástricos con neoplasias malignas embebidos en parafina / Molecular identification of helicobacter pylori in paraffin embedded gastric tissues with malignant neoplasm

Introducción: Helicobacter pylori es considerado uno de los principales agentes causales de gastritis crónica, úlcera péptica y neoplasias gástricas malignas en humanos. Objetivo: evaluar el uso de la reacción en cadena de la polimerasa para la identificación de H. pylori y sus genotipos en tejidos gástricos con neoplasias malignas embebidos en parafina. Material y Métodos: se estudiaron secciones de 5 bloques de parafina procedentes de 5 pacientes mexicanos con neoplasias gástricas malignas. Se realizaron coloraciones de rutina y especiales de anatomía patológica, así como la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa para la detección del microorganismo y sus genotipos. Resultados: la técnica de la reacción en cadena de la polimerasa identificó a este agente infeccioso en todos los bloques analizados en correspondencia con su detección a través de las técnicas histológicas. Esta metodología permitió demostrar una variabilidad genética del patógeno en las muestras analizadas según los genotipos vacA y cagA. Conclusiones: la reacción en cadena de la polimerasa podría ser un método eficaz en la identificación del H. pylori en tejidos gástricos con neoplasias malignas embebidos en parafina. Esta se perfila como una estrategia atractiva para realizar estudios de epidemiología molecular y permitirá establecer posibles asociaciones de genotipos/subtipos del microorganismo con variables clínicas, epidemiológicas y de manejo del paciente.

Introduction: Helicobacter pylori is considered one of the main causal agents of chronic gastritis, peptic ulcer and gastric malignant neoplasms in humans. Objective: to evaluate polymerase chain reaction for identification of Helicobacter pylori and its genotypes in paraffin embedded gastric tissues with malignant neoplasms. Material and Methods: sections of five paraffin blocks from five patients with gastric malignant neoplasms were studied. They were analyzed through routine and special stains of pathological anatomy, as well as the polymerase chain reaction technic for microorganism and genotypes detection. Results: the infectious agent was identified in all of the analyzed blocks through the polymerase chain reaction technic in correspondence with its detection through histologic techniques. This methodology showed a genetic variability of the pathogen in the analyzed samples in respect to vacA and cagA genotypes. Conclusions: the polymerase chain reaction could be an efficacious method for the identification of H. pylori in paraffin embedded gastric tissues with malignant neoplasms. It is projected as an attractive strategy for performing studies of molecular epidemiology and the establishment of possible associations between genotypes/subtypes of the microorganism and clinic or epidemiologic variables, and patient handling.

Infección por helicobacter pylori asociada con neoplasias gástricas malignas en el estado de Guerrero, México. 2001-2011 / Infection by helicobacter pylori associated with gastric malignant in Guerrero state, Mexico. 2001-2011

Introducción: La asociación entre Helicobacter pylori y las neoplasias gástricas malignas ha sido ampliamente demostrada, en relación con esto, la OMS determinó que el microorganismo es agente carcinógeno comprobado del grupo I. En México la prevalencia de infección por esta bacteria es alta. Objetivo: Evaluación de la relación entre variables sociodemográficas, clínicoendoscópicas e histopatológicas con los diferentes tipos de neoplasias gástricas malignas en pacientes Helicobacter pylori positivos y negativos. Pacientes y métodos: Se desarrolló una investigación en la región Sur de México, de tipo retrospectiva, descriptiva e inferencial; se estudiaron 214 casos con adenocarcinoma gástrico y linfoma asociado a mucosas (MALT, por sus siglas en inglés), diagnosticados en el período 2001-2011, de los cuales 99 presentaron Helicobacter pylori. Se utilizaron técnicas estadísticas para evaluar la posible relación entre variables. Procedimientos: Media aritmética y desviación estándar, porcentajes y sus errores. Técnicas: Prueba de Chi² para tablas de contingencia, correlación de rango de Spearman, estimación de parámetros poblacionales, comparación de porcentajes relacionados. Resultados: Se encontraron asociaciones significativas entre el diagnóstico histológico y edades, serotipo sanguíneo, antecedente de familiares con cáncer y la sintomatología (dispepsia y signos de alarma). Y asociaciones muy significativas entre la presencia de Helicobacter pylori con vivos, fallecidos y el diagnóstico histológico. Se determinó que el adenocarcinoma difuso aparece entre 48,8% y 62,4% con una probabilidad de 95% en la población con esta característica, igualmente el porcentaje de neoplasia/tumor dentro del diagnóstico endoscópico oscila entre 68,4% y 80,6% con una probabilidad de 95%. El intervalo de confianza con 99% de certeza para la edad en que se manifiestan estas enfermedades se mueve entre 56 y 62 años. Conclusiones: Queda demostrado que las características sociodemográficas, clínicoendoscópicas e histológicas de los pacientes con adenocarcinoma y linfoma MALT influyen en el diagnóstico final, evolución y pronóstico. La presencia de Helicobacter pylori en estos pacientes fue determinante para su sobrevivencia.

Introduction:The association between Helicobacter pylori and the gastric malignant has been extensively demonstrated, in relation to this, the WHO determined that the microorganism is a carcinogen agent proved from group I. In Mexico the prevalence of infection by this bacterium it is high Objective: Evaluation of the relationship between the socio-demographic, clinical-endoscopic and histopathological variables with the different kinds of gastric malignant in Helicobacter pylori positive and negative patients. Patients and methods: An investigation was carried out to determine the kind of association in a population of the south region of Mexico. The type of research is retrospective, descriptive and inferential, 214 cases with gastric adenocarcinoma and lymphoma associated to the mucosal (MALT) were studied, they were diagnosed from 2001 to 2011, of which 99 had Helicobacter pylori. Statistical techniques to evaluate the possible relationship between variables were used. Procedures: Arithmetic mean and standard deviation, percentages and its errors. Techniques: Chi square test for contingency tables, correlation of Spearman´s range, population parameter estimation, related percentage comparison. Results: It was found meaningful associations between the histologic diagnostic and ages, blood serotype, antecedent of relatives with cancer and the symptomatology (dyspepsia and alarm signs), and very meaningful association between the presence of Helicobacter pylori with alive, deceased and the histologic diagnostic. It was determined that diffuse adenocarcinoma appears between a 48,8% and 62,4% with a probability of the 95% in the population with this characteristics, likewise, the percentage of neoplasm/toumor within endoscopic diagnosis ranges between 68,4% and 80,6% with a 95% probability. The interval of confidence with the 99% of certainty for the age in which these illnesses appear it moves between 56 and 62 years. Conclusions: It has been proved that the socio-demographic, clinical-endoscopic and histologic characteristics of these patients with adenocarcinoma and lymphoma MALT have an influence in the final diagnostic, evolution and prognostic. The presence of Helicobacter pylori in these patients was determining for their survival.

Infección por helicobacter pylori asociada con neoplasias gástricas malignas en el estado de Guerrero, México. 2001-2011 / Infection by helicobacter pylori associated with gastric malignant in Guerrero state, Mexico. 2001-2011

Introducción: La asociación entre Helicobacter pylori y las neoplasias gástricas malignas ha sido ampliamente demostrada, en relación con esto, la OMS determinó que el microorganismo es agente carcinógeno comprobado del grupo I. En México la prevalencia de infección por esta bacteria es alta.Objetivo: Evaluación de la relación entre variables sociodemográficas, clínicoendoscópicas e histopatológicas con los diferentes tipos de neoplasias gástricas malignas en pacientes Helicobacter pylori positivos y negativos.Pacientes y métodos: Se desarrolló una investigación en la región Sur de México, de tipo retrospectiva, descriptiva e inferencial; se estudiaron 214 casos con adenocarcinoma gástrico y linfoma asociado a mucosas (MALT, por sus siglas en inglés), diagnosticados en el período 2001-2011, de los cuales 99 presentaron Helicobacter pylori. Se utilizaron técnicas estadísticas para evaluar la posible relación entre variables. Procedimientos: Media aritmética y desviación estándar, porcentajes y sus errores. Técnicas: Prueba de Chi2 para tablas de contingencia, correlación de rango de Spearman, estimación de parámetros poblacionales, comparación de porcentajes relacionados. Resultados: Se encontraron asociaciones significativas entre el diagnóstico histológico y edades, serotipo sanguíneo, antecedente de familiares con cáncer y la sintomatología (dispepsia y signos de alarma). Y asociaciones muy significativas entre la presencia de Helicobacter pylori con vivos, fallecidos y el diagnóstico histológico. Se determinó que el adenocarcinoma difuso aparece entre 48,8% y 62,4 por ciento con una probabilidad de 95 por ciento en la población con esta característica, igualmente el porcentaje de neoplasia/tumor dentro del diagnóstico endoscópico oscila entre 68,4 por ciento y 80,6 por ciento con una probabilidad de 95 por ciento. El intervalo de confianza con 99 por ciento de certeza para la edad en que se manifiestan estas enfermedades se mueve entre 56 y 62 años...(AU)

Introduction: The association between Helicobacter pylori and the gastric malignant has been extensively demonstrated, in relation to this, the WHO determined that the microorganism is a carcinogen agent proved from group I. In Mexico the prevalence of infection by this bacterium it is high Objective: Evaluation of the relationship between the socio-demographic, clinical-endoscopic and histopathological variables with the different kinds of gastric malignant in Helicobacter pylori positive and negative patients. Patients and methods: An investigation was carried out to determine the kind of association in a population of the south region of Mexico. The type of research is retrospective, descriptive and inferential, 214 cases with gastric adenocarcinoma and lymphoma associated to the mucosal (MALT) were studied, they were diagnosed from 2001 to 2011, of which 99 had Helicobacter pylori. Statistical techniques to evaluate the possible relationship between variables were used. Procedures: Arithmetic mean and standard deviation, percentages and its errors. Techniques: Chi square test for contingency tables, correlation of Spearman´s range, population parameter estimation, related percentage comparison. Results: It was found meaningful associations between the histologic diagnostic and ages, blood serotype, antecedent of relatives with cancer and the symptomatology (dyspepsia and alarm signs), and very meaningful association between the presence of Helicobacter pylori with alive, deceased and the histologic diagnostic. It was determined that diffuse adenocarcinoma appears between a 48,8 percent and 62,4 percent with a probability of the 95 percent in the population with this characteristics, likewise, the percentage of neoplasm/toumor within endoscopic diagnosis ranges between 68,4 percent and 80,6 percent with a 95 percent probability. The interval of confidence with the 99 percent of certainty for the age in which these illnesses appear it moves between 56 and ...(AU)